秦朝只是名义上建立了闽中郡，实际上并未在闽中实施有效统治。
秦朝统一六国以后，分五路大军南征百越，其中一路攻取东瓯（今浙江省一带）和闽越（今福建省一带）。
秦军击败闽越部落后，置闽中郡，治东冶县（位于今福州市城区）。但闽中远离中原难于统治，于是只废去闽越王的王号，仍由其继续统治闽中郡，秦朝未派官吏。
下列图中虚线内为今厦门市行政区划范围。
公元283年西晋时期
秦汉几百年的时间里，今厦门市地区境内一直未置有县级行政机构治所，一直到西晋。
西晋太康三年(282年)置同安县，即今同安区的前身，属晋安郡（治所今福州市区）管辖。后同安县历有废置，也就是说时在时不在，一直到宋朝才稳定下来。
公元612年隋朝时期
隋朝此时，同安县处于被废并入南安县的状态。南安县即今泉州南安市的前身。
公元741年唐朝时期
唐朝此时，今厦门市地区均属泉州管辖，同安县还是不在。
公元1111年北宋时期
北宋此时，同安县已复置，还是属泉州管辖。
北宋哲宗时期的宰相、天文学家、药物学家苏颂，便是此时的泉州府同安县人。
公元1582年明朝时期
明朝的今厦门市地区均属泉州府管辖。其境内除了同安县之外，还存在三个卫所。
了解明朝历史的朋友应该知道明朝独特的卫所制度。其独立于民政系统外，类似如今的生产建设兵团。而千户所相当于县级行政单位，属卫管辖，卫属都司管辖，都司则隶属于中央。
中左千户所，位于今厦门市城区。金门千户所，位于今金门县。高浦千户所，位于今杏林区高浦村一带。三个千户所均属永宁卫管辖。
公元1820年清朝时期
清朝此时的厦门尚未开埠，还是属泉州府管辖，不过境内多了个马巷厅。
厅是清代在新开发区域设置的地方行政机构，分直隶厅与散厅。直隶厅直隶于省，散厅隶于府。以同知或通判为长官。
马巷厅是清乾隆三十九年(1774)置，位于今翔安区马巷镇。马巷厅主官通判为正六品，比同安县主官知县正七品高一点。
民国北洋政府时期
民国初，今厦门市地区均属厦门道管辖。厦门道还管辖着今莆田和泉州两地，治所在思明县。
思明县，1913年由厦门厅改县并改名而置。县名源于清初郑成功在此抗清，将“中左千户所”更名“思明州”，以明志。思明县1933年裁撤，改设厦门市。