本硕连读适用于除医学外的所有专业，而5+3一体化主要适用于医学临床科学专业。5+3一体化指医学临床科学专业的学生就读五年本科加三年研究生，三年研究生在读期间参加医师规范化培训，8年毕业后属于研究生学位学历，入职后不需要再进行规培；而本硕连读指由本科阶段直接保送进入硕士生阶段学习的一种培养方式。
5+3一体化人才培养的培养目标是，加强医教协同，适应我国卫生健康事业发展需要，培养具有良好职业道德、人文素养和专业素质，掌握坚实的医学基础理论、基本知识和基本技能，具备较强的临床思维、临床实践能力，以及一定的临床科学研究和临床教学能力，能独立、规范地承担本专业和相关专业的常见多发病的预防和诊治工作的高水平高素质临床医师。有关高校要根据这一培养目标的要求，创新培养模式、优化培养方案、改革内容方法、健全评价体系、做好政策衔接，不断提高一体化人才培养质量。
有些高校规定本硕连读或硕博连读可以比正常学制提前一年毕业，有利于早出人才、快出人才。但是本硕连读的课程要求也是很严格的，有的学校规定如果一年有三门课程不及格或者七年有四门课程不及格，或者有课程补考也不及格，会被分流到普通本科，而且是降届分流。所以即便是本硕连读也不能放松，还是要认真学习。