1、准确对光的问题
对光是应用显微镜时很主要的一步，有些学生在对光时，随意转一个物镜对着通光孔，而不是按请求必定用低倍镜对光。转动反光镜时爱好用一只手，往往将反光镜扳了下来。所以教师在指点学生时，必定要强调用低倍镜对光，当光线较强时用小光圈，平面镜，而光线较弱时则用大光圈，凹面镜，反光镜要用双手转动，当看到均匀光明的圆形视野为止。光对好后不要随意的移动显微镜，以免光线不能精确的通过反光镜进入通光孔。
2、准确应用准焦螺旋的问题
应用准焦螺旋调节焦距，找到物象可以说是显微镜应用中最主要的一步，也是学生感到最为艰苦的一步。 学生在操作中极易涌现以下毛病：一是在高倍镜下直接调焦 ; 二是不管镜筒上升或降低，眼睛始终在目镜中看视野；三是不懂得物距的临界值，物距调到 2 ～ 3 厘米时还在往上调，而且转动准焦螺旋的速度很快。前两种毛病成果往往造成物镜镜头抵牾到装片，损伤装片或镜头，而第三种毛病则是学生应用显微镜时最常见的一种现象。针对以上毛病，教师必定要向学生强调，调节焦距必定要在低倍镜下调，先转动粗准焦螺旋，使镜筒慢慢降低，物镜靠近载玻片，但注意不要让物镜碰到载玻片，在这个进程中眼睛要从侧面看物镜，然后用左眼朝目镜内注目，并慢慢反向调节粗准焦螺旋，使镜筒缓缓上升，直到看到物像为止，同时向学生解释一般显微镜的物距在 1 厘米 左右，所以如果物距已远远超过 1 厘米 ，但仍未看到物象，那可能是标本未在视野内或转动粗准焦螺旋过快，此时应调剂装片地位，然后再反复上述步骤，当视野中涌现隐约的物象时，就要换用细准焦螺旋调节，只有这样，能力缩小寻找规模，进步找到物象的速度。
3、物镜转换的问题
应用低倍镜后换用高倍镜，学生往往爱好用手指直接推转物镜，以为这样比拟省力，但这样容易使物镜的光轴产生偏斜，原因是转换器的材质质地较软，精度较高，螺纹受力不均匀很容易松脱。一旦螺纹损坏，全部转换器就会报废。教师应指点学生手握转换器的下层转动扳转换物镜。
五、光学玻璃清洗的问题
光学玻璃用于仪器的镜头、棱镜、镜片等。 在制作和应用中容易沾上油污、水湿性污物、指纹等，影响成像及透光率。清洗光学玻璃，应依据污垢的特色、不同构造，选用不同的清洗剂，应用不同的清洗工具，选用不同的清洗办法。清洗镀有增透膜的镜头，如照相机、幻灯机、显微镜的镜头，可用 20% 左右的酒精和 80% 左右的乙醚配置清洗剂进行清洗。清洗时运用软毛刷或棉球沾有少量清洗剂，从镜头中心向外做圆活动。切忌把这类镜头浸泡在清洗剂中清洗，清洗镜头时不要用力擦拭，否则会损伤增透膜，破坏镜头。