种子发芽是先长根后子叶伸出。通常所说发芽实际看到的是胚根。因此发芽期间子叶没有伸出。无法光合作用。不需要光。另外种子有子叶等贮藏营养的器官贮藏有大量营养。无需光合作用提供营养。所以发芽无需光。
光色素种类
叶绿体是光合作用的场所类囊体中含两类色素：叶绿素和橙黄色的类胡萝卜素（胡萝卜素和叶黄素）。通常叶绿素和类胡萝卜素的比例约为3：1。chla与chlb也约为3：1。在许多藻类中除叶绿素a、b外。还有叶绿素c、d和藻胆素。如藻红素和藻蓝素；在光合细菌中是细菌叶绿素等。
叶绿素a、b和细菌叶绿素都由一个与镁络合的卟啉环和一个长链醇组成。它们之间仅有很小的差别。类胡萝卜素是由异戊烯单元组成的四萜。藻胆素是一类色素蛋白。其生色团是由吡咯环组成的链。不含金属。而类色素都具有较多的共轭双键。
全部叶绿素和几乎所有的类胡萝卜素都包埋在类囊体膜中。与蛋白质以非共价键结合。一条肽链上可以结合若干色素分子。各色素分子间的距离和取向固定。有利于能量传递。类胡萝卜素与叶黄素能对叶绿素a、b起一定的保护作用。